Hoewel er al in 1819 wijngaarden en bouwwerken werden geregistreerd in Thibeaud, de plek waar tegenwoordig de huidige wijnmakerij staat, duurde het tot 1975 voordat de naam Château Fleur Cardinale voor het eerst verscheen. Zo werd het landgoed genoemd dat Jean-Louis Obissier, zoon van de burgemeester van Villerouge-Termenes, kocht in de gemeente Saint-Etienne-de-Lisse, ten oosten van Saint-Émilion.
Maar als er een sleuteljaar is in de recente geschiedenis van deze wijnmakerij, dan is dat 2001. Dominique Decoster, voormalig porseleinfabrikant in Limoges, en zijn vrouw Florence kochten toen het landgoed. Zo begon een project dat Château Fleur Cardinale in korte tijd, dankzij zijn kwaliteit, tot een van de meest interessante namen van de rechteroever van Bordeaux maakte.
De knowhow van het wijngaardteam, met het ervaren advies van Jean-Luc Thunevin, de grondlegger van de garagistenbeweging in Bordeaux en eigenaar van het naburige Château Valandraud, bracht het in 2006 naar de status van Grand Cru Classé van Saint-Émilion, een status die in 2012 opnieuw werd bevestigd.
Château Fleur Cardinale strekt zijn wijngaarden uit over bijna 23,5 hectare, verdeeld over 57 percelen die individueel worden bewerkt met behulp van duurzame wijnbouw. Hier zijn tot zeven verschillende bodemsoorten te vinden, hoewel klei en kalksteen, zo kenmerkend voor de A.O.C. Saint-Émilion Grand Cru, duidelijk overheersen. De wijngaard heeft een gemiddelde leeftijd van 38 jaar en is voornamelijk beplant met de druivensoorten merlot (75%), cabernet franc (20%) en cabernet sauvignon (5%). Van deze druiven maakt het huis zijn grand vin, Château Fleur Cardinale, en nog twee andere krachtige en elegante rode wijnen, die uitblinken door hun getrouwe expressie van een unieke terroir.